北部九州農薬物流センターは、北部九州（福岡、長崎、大分）を対象とした、ブロック域における全農の農薬物流拠点として2012年12月に業務を開始しました。
当センターの農薬保管倉庫は、普通物、危険物および毒劇物の農薬に保管対応可能で合計6棟の倉庫を使用し農薬の保管管理をおこなっています。全農薬倉庫の建物床面積は延べ4960m²（1503坪）を有しており、1.1m×1.1mサイズのパレットで2,500枚分、約10万5千ケースの農薬が収容可能となっています。
当センターの特徴として、農家別に商品バーコードを利用して仕分を支援するデジタルアソートシステムと、商品バーコードとハンディ端末を利用して入出庫、在庫管理をおこなう倉庫管理システムを導入し、効率的で迅速な物流サービスを提供しております。
デジタルアソートシステムは、農家別セット組みの作業において、作業ミスの防止、作業の標準化（商品知識や経験に捉われない）、省人化、作業スピード向上の効果をもたらし、倉庫管理システムは、集品時間の削減、品目相違ミス防止、リアルタイムでの在庫管理が可能で、作業の効率化および在庫管理の精度向上に繋がっております。