海運事業では、内航船による国内輸送と近海船による輸入原料の輸送をおこなっています。内航輸送は、輸入穀物・肥料などを全国の飼料・肥料工場へ定期的に輸送しているほか、北海道産小麦輸送など年間180万トンの海上輸送をおこなっています。近海輸送は、東南アジアから肥料・飼料などを年間約17万トン輸送しています。